Southern杂交
实验原理
Southern印迹杂交(Southern blot)是1975年由英国人southern创建,是研究DNA图谱的基本技术。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNAl片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNAl片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,湖南pcr,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放l射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量。
RIP
技术概述
RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物,裂解细胞后,用靶蛋白特异的抗l体(或标签抗l体)做免l疫沉淀,获得“靶蛋白-RNA”互作复合物,dna检测,去交联分离其中的RNA;针对预测的靶蛋白结合RNA的序列设计引物,
做qPCR实验,验证预测的RNA是否与靶蛋白有结合,或者将分离出来的RNA做高通量测序,筛选到可能与靶蛋白结合的RNA。
技术流程
细胞交联-→细胞裂解-→免l疫共沉淀→去交联→RNA分离→建库→高通量测序(或qPCR)。
二、大肠菌群检验方法:
由于大肠菌群指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的细菌,实时荧光定量pcr,即:需氧及兼性厌氧、在37°C能分解乳糖产酸产气的革兰氏阴性无芽胞。因此大肠菌群的检测一般都是按照它的定义进行。 目前国内采用的进出口食品大肠菌群检测方法主要有和原地区商检局制订的行业标准。两个标准方法在检测程序上略有不同。
(一):采用三步法,PCR,即:乳糖发酵试验、分离培养和证实试验。乳糖发酵试验:样品稀释后,选择三个稀释度,每个稀释度接种三管乳糖胆盐发酵管。36士1C培养48土2h,观察是否产气。分离培养:将产气发酵管培养物转种于伊红美蓝琼脂平板上,36士1°C培养18-24h,观察菌落形态。证实试验:挑取平板上的菌落,进行革兰氏染色观察。同时接种乳糖发酵管36士1°C培养24土2h,观察产气情况。
报告:
根据证实为大肠阳性的管数,查MPN表,报告每100ml ( g)大肠菌群的MPN值。具体操作参见GB4789. 3-94 《*人民共和国食品卫生微生物学检验大肠菌群测定》
(二)原地区商检局制订的行业标准,等效采用美国FDA的标准方法,用于对出口食品中的大肠进行检测。本方法采用两步法:推测试验:样品稀释后,选择三个稀释度,每个稀释度接种三管LST肉汤。36士1C培养48士2h,观察是否产气。证实试验:将产气管培养物接种煌绿乳糖胆盐(BGLB)肉汤管中,36士1°C培养48士2h,观察是否产气。以BGLB产气为阳性。查MPN表,报告每ml(g)样品*肠菌群的MPN值。具体操作参见SN0169-92《*人民共和国进出口商品检验行业标准 出口食品*肠菌群、粪大肠菌群和大肠检验方法》
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