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气相色谱仪分离度下降的原因分析
气相色谱仪柱温不同。检查柱温。
不同的气相色谱仪色谱柱的维数和相位。核实色谱柱的特性。
改变载气流速。
气相色谱仪色谱柱受污染，应用溶媒清洗柱子。
进样器的改变。检查进样器的设置。
气相色谱仪样品的浓度或溶解能力的改变。试用一个不同的浓度。
色谱柱使用误区
避免压力和温度的急剧变化
温度的突然变化或者使色谱柱从高处掉下都会影响柱内的填充状况；柱压的突然升高或降低也会冲动柱内填料，因此在调节流速时应该缓慢进行，以保持色谱柱内填料的稳定性。
避免直接改变溶剂的组成
在需要改变检测样品溶液组成是，应逐渐改变溶剂的组成，特别是反相色谱中，不应直接从改变为全部是水，反之亦然。且在使用次洗脱能力强的 洗脱液冲洗色谱柱时，对流路系统中流动相的置换应以相混溶的溶剂逐渐过渡，每种流动相的体积应是柱体积的20倍左右，即常规分析需要50~75ml。

液相色谱仪基线漂移解决方法
控制好柱子和流动相的温度，在检测器之前使用热交换器;
使用HPLC级的溶剂，高纯度的盐和添加剂。流动相在使用前进行脱气，使用中使用在线脱气或氦气脱气。
用甲醇或其他强极性溶剂冲洗流通池，如有需要，可以用1n的硝酸。(不要用盐酸)
取出阻塞物或更换管子。参考检测器手册更换流通池窗。
更改配比或流速。为避免这个问题可定期检查流动相组成及流速。
用中等强度的溶剂进行冲洗，更改流动相时，在分析前用10～20倍体积的新流动相对柱子进行冲洗。使用离子对试剂、缓冲盐较应注意平衡柱。
检查流动相的组成。使用高品质的化学试剂及HPLC级的溶剂
改变分析条件。使用保护柱，如有必要，在进样之间或在分析过程中，定期用强溶剂冲洗柱子。
重新设定基线。使用新的流动相。
将波长调整至大吸收波长处。重选检测波长。

液相色谱仪基线漂移产生的原因
柱温波动。(即使是很小的温度变化都会引起基线的波动。通常影响示差检测器、电导检测器、较低灵敏度的紫外检测器或其它光电类检测器。)
流动相不均匀。(流动相条件变化引起的基线漂移大于温度导致的漂移。)
流通池被污染或有气体;
检测器出口阻塞。(高压造成流通池窗口破裂，产生噪音基线);
流动相配比不当或流速变化;
柱平衡慢，特别是流动相发生变化时;
流动相污染、变质或由低品质溶剂配成;
样品中有强保留的物质(高k’值)以馒头峰样被洗脱出，从而表现出一个逐步升高的基线。
使用循环溶剂，不提倡。未调整检测器。
检测器没有设定在大吸收波长处。

液相色谱仪流动相溶剂使用的应注意下事项：
若需要使用含盐的流动相，使用前请务*滤。并且使用该含盐流动相前，色谱柱需先用低比例**相（**相含量应不**10%）的溶液冲洗，以免缓冲盐析出。流动相若为蒸馏水或含盐的缓冲液，建议现用现配，以免流动相因滋生微生物而造成柱填料的污染。
进行梯度实验时要注意梯度变化过程中流动相的互溶性，避免因流动相不互溶而导致的缓冲盐析出问题。反相系统更换正相系统或正相系统更换反相系统时，用异丙醇置换系统内的储存流动相后在接柱子。
气相色谱仪产生故障的可能原因及排除方法：
气相色谱仪进样器的温度太低，排除方法是提高进样器的温度；
柱子中的样品过载，排除方法是分流进样；
气相色谱仪升温太慢，排除方法是改变气相色谱的升温程序。

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