FFPE样本DNA提取试剂盒适用于各种不同FFPE组织样本及低质量样本的提取,兼容手动提取及自动化提取程序,提取基因组DNA产量高、纯度好,蛋白和RNA污染低。
疾病研究和病理分析中,由于通过手术、穿刺等方式处理的组织样本离开机体后,很快就会发生腐烂及组织,丧失原有正常的结构和功能。因此,离体的组织要经固定、石蜡包埋、切片及染色等步骤以避免细胞组织,进而进行形态结构分析及*或分子分析等。比如应用FFPE样本DNA提取试剂盒处理组织结构。
FFPE样本的特点:FFPE样本,即用福尔马林固定、石蜡包埋的组织样本。因其能较好地维持组织细胞的结构,便于研究及较好地保存样本,该方法已经被普遍应用。组织样本在前处理中的不规范操作,可能会导致不同程度的DNA损伤,影响NGS检测。
FFPE样本DNA提取试剂盒的产品特点:
1、基于纳米磁珠的提取纯化技术;
2、高载量,高提取效率;
3、适合手工提取及自动化工作站使用; 操作便捷;
4、提取产物可用于PCR、实时荧光定量PCR、二代测序等。
FFPE样本DNA提取试剂盒的常见问题分析及解决方法:
从前处理、提取、建库到测序分析,FFPE样本常见问题复杂多样,其中绝大部分问题和样本直接相关,可以通过回溯实验过程及分析来优化实验。
1、文库复杂度低
原因:样本质量差:测序深度太高;
优化方法:规范前处理、核酸提取过程;检查设备状态等;调整测序深度。
2、文库片段短
原因:样本质量差;打断时间过长
优化方法:规范前处理;调整打断时间。
3、文库总量低
原因:核酸投入/杂交投入量低;样本质量差;实验操作不规范;
优化方法:投入足够量的核酸,规范实验操作。
福尔马林固定石蜡包埋( Formalin Fixed andParaffin Embedde, FFPE)成为病理学、法医病理学等进行样本保存的主要手段。对组织样本进行FFPE的保存,有助于研究人员较加深入地了解经多年保存后的病理标本中所包含的遗传机制和病理成因。目前,**约有2-4亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究宝贵的的生物学资源之一。
FFPE样本DNA提取试剂盒的产品优势:
1、高纯:提取基因组DNA产量高、纯度好,蛋白和RNA污染低;
2、兼容:适用于各种不同FFPE组织样本及低质量样本的提取;
3、安全:操作简单,无酚、氯仿等溶剂;
4、自动化:兼容手动提取及自动化提取程序。
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