FFPE样本DNA提取试剂盒,不会引入由于提取环节的不标准而导致的实验偏差。适用多种组织样本,采用纳米磁珠和特制的缓冲液系统,可从FFPE样品中提取高质量的基因组DNA。
FFPE样本DNA提取试剂盒为福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样品中的总RNA和基因组DNA的连续分离和纯化提供了一种快速方法。使用该试剂盒将RNA和DNA依次纯化成单的组分。能够纯化大部分的RNA,从大的mRNA和核糖体RNA到microRNA和小干扰RNA,取决于FFPE组织的年限,因为RNA的片段化程度将随着时间增加。在不使用或氯仿的情况下从其他细胞组分中纯化RNA。纯化的RNA具有较高的完整性,可用于许多下游应用,包括实时PCR,逆转录PCR,RNA印迹,RNA酶保护和引物延伸,以及表达谱测定。纯化的基因组DNA也具有较高质量,可用于PCR反应,测序,Southern印迹和SNP分析。
福尔马林固定石蜡包埋( Formalin Fixed andParaffin Embedde, FFPE)成为病理学、法医病理学等进行样本保存的主要手段。对组织样本进行FFPE的保存,有助于研究人员较加深入地了解经多年保存后的病理标本中所包含的遗传机制和病理成因。目前,**约有2-4亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究宝贵的的生物学资源之一。
FFPE样本DNA提取试剂盒的应用步骤:
1、从源头抓起,完善样本的前处理
离体时间:取材后应在30min内及时固定,防止组织变质。
样本要求:选择合适大小的组织块制作石蜡包埋组织样本,一般不**过15x10x5mm。
固定液选择:建议使用10%中性福尔马林固定液,对组织进行固定,固定液应为被固定标本体积的5-10倍,并定期更换。
固定时间:根据样本情况调节固定时间,一般在24-48h为宜,固定时间过长会加重FFPEDNA的片段化。
包埋要求:选用纯净且熔点适宜的蜡,包埋要迅速,禁用明火。
切片厚度:包埋好的组织样本根据需要确定切片厚度,标准切片厚度为4um,用于核酸提取的切片可以在10-20um,保证切片厚度的持续稳定。
2、选择合适的提取试剂盒
目前市场上有多种提取试剂盒,应选择合适的试剂盒才能保证实验的成功率。
福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)是组织样本常见的保存方式,FFPE样本DNA提取试剂盒采用具有特有分离作用的纳米磁珠和特制的缓冲液系统,可从FFPE样品中提取高质量的基因组DNA。
FFPE样本DNA提取试剂盒的操作过程便捷,提取的核酸得率高,质量稳定可靠,可供PCR、实时荧光定量PCR、二代测序等使用。FFPE样本DNA提取试剂盒是基于磁珠法的分离系统,适用于高通量的自动化提取流程。
随着基因组学检测技术的快速发展,尤其新一代测序技术 (NGS) 的飞速发展,在细胞分子水平提供了新的的检测能力,研究人员可以使用这一技术手段,重新开启FFPE样本宝藏的大门,寻找疾病与基因关系,进而去解释疾病的未解之谜。然而,在FFPE组织标本的制备和贮存过程中,组织经福尔马林固定、石蜡包埋后很容易引起DNA的交联和降解,研究人员很难获得足量的高质的DNA样本,这也对新的检测技术提出新的要求。
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