ubi20z任务的计算方法和内容部分,“#”指以正常形式输出计算结果,若希望以更为详细的形式输出结果,可写作“#P”,若希望以精简形式输出,可写作“#T”,“b3lyp”决定本次模拟采用DFT方法并选用b3lyp泛函进行计算,泛函应根据实际需要进行选择,此处给出的较为通用且精度尚可的杂化泛函,例如Summary中包含了当前帧的基本信息(电子自旋、能量等),Optimization可显示优化过程中体系的能量和平均受力(RMS)变化情况。
可载入GaussView中,对计算结果或计算过程中的一些结构变化进行分析,检查点文件:文件后缀名通常为,chk或,fchk,包括轨道系数、密度矩阵等输出文件中未涵盖的重要信息,可载入Multiwfn进行数据分析,读写文件:文件后缀名通常为,注:在未特别说明的情况下,本文中涉及到的所有量化模拟实例均是在本地电脑(Windows系统)建模并生成输入文件,在服务器(Linux系统)中进行计算,在本地电脑进行数据处理和分析。
输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。
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