血浆病原DNA提取试剂盒提取的核酸纯度高。核酸纯度一般根据OD260/OD280比值来判断。一般说来,试剂盒提取的DNA其OD260/OD280比值应在1.6--1.8之间。
血浆病原DNA提取试剂盒的操作步骤:
1、取出洗涤液,按以下操作:
洗涤液A:21mL加入9mL无水乙醇;42mL加入18mL无水乙醇,混匀。
洗涤液B:9mL加入21mL无水乙醇;18mL加入42mL无水乙醇,混匀。
配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。
2、取1.5mL离心管,加入200μL血液样本,再加入200μL 裂解液及40μL 消化液,振荡混匀,65℃水浴10 分钟。
3、加入150μL异丙醇(总体积的25%),混合均匀,如有半透明悬浮物,不影响DNA的提取与后续实验。
4、将吸附柱放入收集管内,将上述溶液转入吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液;
5、将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液A至吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液。
6、将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液B至吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液。
7、按每份样本40μL 取洗脱液,放置于灭菌1.5mL离心管,65℃预热。
8、将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 离心2 分钟,离去残留的洗涤液。
9、取出吸附柱,放入新的1.5 mL 灭菌离心管内,在吸附柱中心加入40 μL 预热洗脱液,静置2分钟,12,000 rpm 离心1分钟,收集DNA溶液。提取的DNA即可用于下一步实验或-20℃保存。
一般来说,血清血浆的量与提取的核酸量成正比。因而,如果要提高核酸得率,可通过增加血清或血浆的量来实现。一般地,做血浆或血清核酸提取,样本量在1ml以上。如果1ml或较大量样本得不到满意的检测结果,则应及时考虑更换提取试剂盒。血浆病原DNA提取试剂盒的核酸提**率较高,1ml病人血浆样本DNA得率在85ng左右,Q的得率在72ng左右,T的得率在63ng左右,基本上都能满足下游PCR实验的需求。其检测下限为2ng/ul。如洗脱液为30ul,则需要1ml左右的血浆才能检测出来。显然,如果是健康人的血浆,1ml血浆的DNA浓度较低。因而,血浆DNA提取完成以后,应该直接做PCR。
血浆病原DNA提取试剂盒中时间成本、生产率的考虑:
当一次处理**过50个样本时,不再考虑使用小量柱纯化,高通量DNA提取试剂盒是较好的选择,它可以以96孔的形式运行,以便在需要同时处理多个样本的DNA的实验。
DNA提取试剂盒有各种规格和大小,然而,共同的主线是,所选择的试剂盒能产生干净和浓缩的DNA。可以定期评估DNA提取物的数量和质量,以确保试剂盒适合此应用类型。
在选择DNA提取试剂盒时,较重要的变量可能是你所使用的生物体。
1、许多试剂盒都有用于DNA分离的不同成分,这些试剂盒之间的主要区别在于细胞是如何被分解的,因为有些比其他较较有挑战性。例如,形成生物膜的可能比传统的基于去垢剂的方法需要较强的裂解技术。
2、动物组织:用于动物组织DNA分离的试剂盒通常具有较温和的裂解技术,因为大多数动物细胞不像细胞那样有细胞壁。然而,动物组织DNA提取的挑战往往在于选择合适的组织匀浆方法。此外,许多动物DNA纯化试剂盒不使用/氯仿萃取或乙醇作为沉淀步骤,以减少破坏DNA的风险。
3、植物:当涉及到植物DNA分离时,必须考虑到其他一些因素,需要注意污染物的去除。植物在纯化过程中通常含有未分离的糖,因此,洗涤剂选择性地与DNA结合并从溶液中析出,通常是先将洗涤剂溶解在高浓度的盐溶液中,然后提取DNA。
4、血液:由于技术上的许多新进展,血液DNA分离试剂盒中有多种裂解技术和提取方法可供选择。从血液中分离出的DNA将在很大程度上决定你使用的裂解和提取的类型。无论应用是什么,一定要选择一种能够提供纯净、完整、双链和浓缩DNA的试剂盒,以获得较好地效果。
一般来说,质粒DNA分离要比基因组DNA分离温和。这是因为针对质粒DNA的裂解步骤需要染色体DNA与细胞蛋白片段保持结合,以防止其污染终的样品。两种类型的DNA回收都有试剂盒,甚至有可以同时纯化基因组DNA和总RNA的试剂盒。
当使用血浆病原DNA提取试剂盒分离不同血液体积样本时,能表现得较好,在于提取较高的DNA产量和纯度。
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