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大肠杆菌属的系统发育：大量属于该物种的菌株已得到分离和鉴定。除了血清型(videsupra)，它们还可以根据它们的系统发育(即推断的进化史)进行分类。如下所示，其中该物种分为六组。特别是全基因组序列的使用产生了高度支持的系统发育。基于这些数据，大肠杆菌的5个亚种被区分开来。系统发育距离(“关联性”)和病理学之间的联系很小，云南游动放线菌菌种，云南游动放线菌菌种，例如O157：H7血清型菌株形成一个分支(“一个独特的群”)—下面的E群——都是肠出血性菌株(EHEC)，但并不是所有的EHEC菌株都是密切相关的。事实上，四种不同的志贺氏菌嵌套在大肠杆菌菌株(见上)，然而E.albertii和E.fergusonii不属于这个群体。事实上，在包括类型菌株在内的系统基因组研究中，所有志贺菌都被放在大肠杆菌的一个亚种内，因此很难进行相应的重新分类。所有常用的研究菌株大肠杆菌属于a组，主要来源于Clifton的K-12菌株(λ⁺f⁺，云南游动放线菌菌种。O16)并且在较小程度上来自d'Herelle的大肠杆菌菌株(B菌株)(O7)。大多数的大肠杆菌菌株具有荚膜或微荚膜结构，但是不能形成芽孢。云南游动放线菌菌种

SHBCCD73798侏罗纪地芽孢杆菌SHBCCD73798=VKMB-2301Geobacillusjurassicus模式菌株SHBCCD73799热球状尿素芽孢杆菌SHBCCD73799Ureibacillusthermosphaericus模式菌株SHBCCD73800强酒海杆状菌SHBCCD73800=CCUG52119Marinobactervinifirmus模式菌株SHBCCD73801拉浩尔谷农球菌SHBCCD73801=CGMCC1.7259=CGMCC1.8869=JCM14301=MTCC7154Agrococcuslahaulensis模式菌株SHBCCD73802解纤维素木聚糖单胞菌SHBCCD73802=CECT5975=LMG20990Xylanimonascellulosilytica模式菌株SHBCCD73803斯氏片球菌SHBCCD73803=CCUG51290=LMG23082Pediococcusstilesii模式菌株SHBCCD73804“冰川盐单胞菌”SHBCCD73804=MTCC4321Halomonasglaciei模式菌株SHBCCD73805柠檬黄色农球菌SHBCCD73805=ATCC700859=CCM4975=CIP106287=DSM12453=CGMCC1.6150Agrococcuscitreus模式菌株SHBCCD73806光神农球菌SHBCCD73806=CCM4953=CIP107635=DSM14215=CGMCC1.6144Agrococcusbaldri模式菌株SHBCCD73807缺陷短波单胞菌SHBCCD73807BrevundimonasdiminutaSHBCCD73808杀虫贪铜菌SHBCCD73808CupriavidusnecatorMutantfromDSM428,doesnotformpoly-β-hydroxy-butyrateSHBCCD73809杀虫贪铜菌SHBCCD73809=ATCC17699  安徽黄杆菌菌种枯草芽孢杆菌的芽孢0.6~0.9×1.0~1.5微米，椭圆到柱状。

金黄色葡萄球菌（Staphylococcusaureus），又称金葡菌，是一种常见的革兰阳性菌，普遍存在于空气、水、灰尘及人和动物的排泄物中。它是一种生物共患病原菌，可导致人和动物的多种疾病，包括伪膜性肠炎、败血症和脓毒症等，严重威胁人类和动物的生命安全。长期以来，青霉素和甲氧西林普遍用于救治敏感菌引起的传染性疾病。随着抑菌药物的大规模使用以及人类的滥用和不合理使用，耐药菌株层出不穷。金葡菌耐药性较为突出，其中以耐甲氧西林金葡菌(Methicillin-resistantS.aureus，MRSA)危害较大。据报道显示，MRSA传染已经和HBV传染、AIDS并列为世界范围内三大难解决传染性疾病。

不同标本来源金黄色葡萄球菌的MRSA分离率和耐药分析：导管、痰液、血液、脓液、分泌物MRＧSA的分离率分别是66.7％、55.6％、51.7％、40.0％、38.9％，导管的MRSA分离率明显高于血液、脓液、分泌物，差异有统计学意义(P＜0.05).分泌物、脓液与血液的MRSA分离率差异无统计学意义(P＞0.05).除万古霉素、奎奴普丁/达福普汀、呋喃妥因外，导管分离株对常用抑菌药物的耐药率较高(P＜0.05)，其次是痰液、血液，而分泌物与脓液较低(P＜0.05)。痰液与血液对多数常用抑菌药物的耐药率差异无统计学意义(P＞0.05).分泌物分离株对庆大霉素、左氧氟沙星、复方磺胺甲恶唑、米诺环素的耐药率明显低于导管、痰液、血液分离株的耐药率(P＜0.05)。大肠杆菌的规格可根据客户的需求来进行定制。

大肠杆菌可以在多种底物上生存，并在厌氧条件下使用混合酸发酵，产生乳酸盐、琥珀酸盐、乙醇、乙酸盐和二氧化碳。由于混合酸发酵中的许多途径产生氢气，因此这些途径要求氢气水平低，例如大肠杆菌与耗氢生物如产甲烷菌或硫酸盐还原菌生活在一起。大肠杆菌在37°C(98、6°F)条件下生长至佳，但一些实验室菌株在49°C(120°F)条件下可以繁殖。大肠杆菌生长在各种确定的实验室培养基中，如LB培养基或任何含有葡萄糖、磷酸一铵、氯化钠、硫酸镁、磷酸氢钾和水的培养基。生长可以通过有氧或无氧呼吸来驱动，使用多种氧化还原对，包括酸、甲酸、氢和氨基酸的氧化，以及底物如氧、硝酸盐、富马酸盐、二甲基亚砜和三甲胺氮氧化物的还原。[21]大肠杆菌被归类为兼性厌氧菌。当氧气存在并可用时，它就使用氧气。然而，它可以通过发酵或厌氧呼吸在无氧条件下继续生长。在无氧条件下继续生长的能力对细菌来说是一个优势，因为在水占主导地位的环境中，细菌的存活率会提高的。金黄色葡萄球对高温有一定的耐受能力，在80℃以上的高温环境下30min才可以将其彻底杀死。广西微枝形杆菌菌株

金黄色葡萄球是一群革兰氏阳性球菌，因常堆聚成葡萄串状，故名。云南游动放线菌菌种

    SHBCCD73884艾比湖嗜盐碱红菌SHBCCD73884NatronorubrumaibienseSHBCCD73885西藏嗜盐碱红菌SHBCCD73885NatronorubrumtibetenseSHBCCD73886产硫化物嗜盐碱红菌SHBCCD73886NatronorubrumsulfidifaciensSHBCCD73887西藏嗜盐碱红菌SHBCCD73887NatronorubrumtibetenseSHBCCD73888产硫化物嗜盐碱红菌SHBCCD73888NatronorubrumsulfidifaciensSHBCCD73889新疆盐红菌SHBCCD73889HalorubrumxinjiangenseSHBCCD73891噬糖盐红菌SHBCCD73891HalorubrumsaccharovorumSHBCCD73892解淀粉嗜盐碱球菌SHBCCD73892NatronococcusamylolyticusSHBCCD73893特班齐赫盐红菌SHBCCD73893HalorubrumtebenquichenseSHBCCD73894艾比湖嗜盐碱红菌SHBCCD73894NatronorubrumaibienseSHBCCD73896解淀粉嗜盐碱球菌SHBCCD73896NatronococcusamylolyticusSHBCCD73897艾比湖嗜盐碱红菌SHBCCD73897NatronorubrumaibienseSHBCCD73898隐藏嗜盐碱球菌SHBCCD73898NatronococcusoccultusSHBCCD73899长盐土生古菌SHBCCD73899HaloterrigenalongaSHBCCD73900长盐土生古菌SHBCCD73900HaloterrigenalongaSHBCCD73901厌糖盐土生古菌SHBCCD73901HaloterrigenasaccharevitansSHBCCD73902厌糖盐土生古菌SHBCCD73902Haloterrigenasacc 云南游动放线菌菌种

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