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    一、测序策略：DNA样本检测：检测DNA样本的完整性、浓度和纯度等；文库构建：DNA样本检测合格后，将基因组DNA随机打断成300-500bp大小，DNA末端连接接头，纯化连接产物，PCR扩增，浙江抗体全迈杰转化医学NGS平台创新服务，完成文库构建，文库构建后进行质检；上机测序：文库质检合格后，上机测序。二、样本要求：请老师自行提取DNA或cDNA，干冰送样。DNA样本要求：DNA浓度≥50ng/ul，浙江抗体全迈杰转化医学NGS平台创新服务，总量≥3ug；OD260/280在，无RNA、蛋白质等杂质污染，浙江抗体全迈杰转化医学NGS平台创新服务，无降解。三、分析内容：原始测序数据说明原始测序数据质控原始测序数据质量剪切及统计物种注释及丰度分析物种注释基本步骤物种丰度分析物种多样性分析物种***性差异分析四、报告模板：查看完整的宏病毒组结题报告模板请点击：Seqmore_宏病毒测序分析结题报告.pdf。迈杰转化医学拥有专业的病理医生提供相应的阅片或远程病理阅片服务。浙江抗体全迈杰转化医学NGS平台创新服务

    一、初现庐山真面目一代测序：又称Sanger测序（多分子，单克隆）历史：***代DNA测序技术（又称Sanger测序）在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成***个基因组序列（噬菌体X174），全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进（如使用了不同策略的作图法、鸟***法），2001年完成的较早人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础。原理：在4个DNA合成反应体系（含dNTP）中分别加入一定比例带有标记的ddNTP（分为：ddATP,ddCTP,ddGTP和ddTTP），通过凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的DNA序列。由于ddNTP的2’和3’都不含羟基，其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键，因此可以用来中断DNA合成反应。二、江山辈有人才出二代测序：NGS技术（多分子，多克隆）背景：Sanger测序虽读长较长、准确性高，但其测序成本高通量低等缺点，使得denovo测序、转录组测序等应用难以普及。经过数据不断的技术开发和改进，以Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa，Hiseq技术，ABI公司的Solid技术为标记的第二代测序技术诞生，后起之秀ThermoFisher的IonTorrent技术近年来也杀入历史舞台。广东标准迈杰转化医学NGS平台值得推荐迈杰中心实验室设有SLAN 96P、Rotor-Gene Q、ABI 7500、ABI ViiA7、Roche z480等实时荧光定量PCR仪及数字PCR仪！

    ***代测序技术1975年由FrederickSanger所提出的链终止法以及1977年由WalterGibert所发明的链降解法被称为***代测序技术。1977年，WalterGilbert和FrederickSanger发明了***台测序仪，并应用其测定了***个基因组序列，噬菌体X174，全长5375个碱基。WalterGilbert和FrederickSanger也因在测序技术中的贡献获得了1980年诺贝尔化学奖。技术原理目前，基于***代测序技术的测序仪几乎都是采用Sanger提出的链终止法。链终止法测序的**原理是ddNTP的2'和3'端都不含羟基，因此在合成核酸链的过程中无法形成磷酸二酯键，从而导致DNA合成反应中断。在测定待测核酸片段的序列时，向反应体系中加入一定比例的带有放射性同位素标记的4种ddNTP，利用DNA聚合酶来延伸结合在待测核酸模板上的引物，直到掺入一种链终止核苷酸为止，**终会得到一组长度各相差一个碱基的链终止产物，这些产物可通过高分辨率变性凝胶电泳分离并根据其长度排序，凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影进行检测，从而确定目的核酸片段各个位置的碱基。完整的测序过程分为4步：：如要利用Sanger测序方法进行完整基因组的测定，首先要将提取得到的样品完整DNA打碎，形成DN**段，如只是测定单个目的基因的序列。

    二代测序是一个强大的功能平台，它可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。由于这种可以多个样本同时测序的能力，在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面，二代测序也就是高通量测序开创了革命性的领域。早在1900年代就发明的Sanger测序法，成为了DNA测序的黄金法则，即便到了***它仍被***用来进行常规测序和NGS数据的验证。它利用高保真DNA聚合酶生成与单链DNA模版互补的拷贝。在每个反应中，一个可以特异性识别模版的单链引物，可以从3端开始启动DNA合成，根据碱基互补配对原则，脱氧核糖核苷酸或简单的核苷酸是一个接一个的与模版配对。每个反应还包含四种双脱氧核糖核苷酸的混合物，每一种对应一个DNA碱基。这些双脱氧核糖核苷酸与DNA单体十分类似，因此可以参与DNA链的增长，但是他们和天然的脱氧核糖核苷酸有两点不同：（1）他们缺少一个会影响DNA链进一步衍生的3’羟基。在DNA延伸过程中，这个3’羟基一旦加入DNA分子中就会导致链的终止；（2）每个双脱氧核糖核苷酸都有独特的荧光染料吸附，使得DNA测序的自动检测得以进行。 MSH2抗体试剂 苏苏械备20180568号.

    染色体STR不属于测序技术的，它是一类分子检测技术，例如Y染色体-STR，一般通过PCR、电泳凝胶结合来分析这段串联重复序列的存在或者多态性，常用来检测性别或亲子鉴定，而不能测出具体的DNA序列信息。测序技术是一代测序（sanger测序）、二代测序（高通量测序）、三代测序（单分子测序）为基础的。二代测序的缺点主要是由其PCR边复制边读取的原理决定的，测序时间长，读长短，末端质量差。三代测序中PacBio实际上就是针对这些缺点的升级，通过巧妙的微孔设计实现单分子读取，而且可以屏蔽游离dNTP的信号，不用每读取一次就要清洗—添加一次dNTP，所以读长比较长，测序速度快。就是样本—提DNA—打成小片段，然后就开始PCR啊末端修复啊加A啊片段选择啊一系列，***得到片段大小为300-500bp的DNA，ok文库搞定。虽然这行真的干的烦死了，不过离开了真的很想念。 迈杰基于基因组学、蛋白组学、细胞组学及病理组学等综合性转化医学平台，丰富的伴随诊断开发经验。重庆标准迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

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  上述任一所述复合扩增体系还可包括进行pcr扩增反应所需的试剂。所述“进行pcr扩增反应所需的试剂”不包括pcr扩增反应所需的引物。上述任一所述复合扩增体系可为20μl，由10μl2×mastermix、上述任一所述引物组合和模板组成。2×mastermix具体可为德国qiagen公司的产品。所述模板具体可为浓度为1ng/μl的标准品2800m的水溶液或样品的基因组dna。所述样品可为人口腔拭子。所述标准品2800m具体可为promega公司的产品，产品目录号为dd7251。含有上述任一所述引物组合的试剂盒也属于本发明的保护范围；所述试剂盒的用途可为(h1)-(h5)中的至少一种：(h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)个体识别；(h4)亲权鉴定；(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述复合扩增体系或上述任一所述试剂盒的制备方法；该制备方法包括将上述任一所述引物组合中的各条引物单独包装的步骤。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系在制备试剂盒中的应用；所述试剂盒的用途可为(h1)-(h5)中的至少一种：。浙江抗体全迈杰转化医学NGS平台创新服务

迈杰转化医学研究（苏州）有限公司于2013年成立，其前身为凯杰（苏州）转化医学研究有限公司。基于基因组学、蛋白组学、细胞组学及病理组学等综合性转化医学平台，丰富的伴随诊断开发经验，高质量的管理体系以及高素质的研发管理团队，迈杰转化医学为全球合作伙伴提供***生物标记物发现、靶点验证、新药临床试验病人的分型研究和入组筛选、伴随诊断开发与商业化、患者用药指导检测等一体化解决方案，并已迅速发展成为中国伴随诊断领头创新企业，致力于解决创新药物的研发痛点及患者的用药痛点，助力精细医疗！

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