PRIMERPLEX软件教程软件怎样用

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"We bought the AlleleID® and so far I'm very happy with it. I designed species specific primers with AlleleID® (after having tried manually for some days) and the results are very good (really specific amplifications). That was for a sybr green detection. And I have to say the support team is really helpful when you face problems." -Ms. Cecile Thonar, ETH Zurich, Switzerland.

"We have designed several primer/probe sets for reverse-transcription quantitative PCR using TaqMan. All have worked very well. We particularly like the way that the primers/probes are 'scored' as best, good or poor, it is much more convenient than other programs we have used. We also like the integrated BLAST feature. We are very satisfied customers and have recommended the product to our colleagues and collaborators." -Ms. Laura O'Hara, University of Cambridge, UK.

功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex，您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示佳可能的。
多重PCR引物设计
设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计优的多重引物集，大限度地减少Tm失配所有的进行交叉反应分析，以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的各种排序顺序中选择适合您的实验需求的。使用PrimerPlex，您可以灵活地设计引物，无论是朝向3'端，还是5'端，在这些端点的距离或序列内的任何地方。
对于SNP的基因型分析，该程序设计了引物旁侧突变，如SNPs、DIPs（/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性）。
全面的分析支持
使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性，以确保高信号强度，大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。
Multiplex PCR Primer Design
Designing primer sets that work well for a multiplex assay can be a challenging task. PrimerPlex uses innovative and proprietary algorithms to design optimal multiplex primer sets, minimizing Tm mismatches. All sets are analyzed for cross reactivity to ensure specific and efficient amplification. You can choose the set best suited for your experimental needs from a list of alternates presented in variously sortable order. Using PrimerPlex, you have the flexibility of designing primers either towards the 3' end, the 5' end, at a specified distance from these ends or anywhere within the sequence.
Next Generation Sequencing Assay
With PrimePlex, designing multiplex oligos for pre-sequencing sample preparation and mutation detection such as SNPs, DIPs (Deletion/Insertion Polymorphisms) and MNPs (Multiple Nucleotide Polymorphisms) is as easy as clicking a few buttons.

"Beacon Designer™ 2 was incredibly straight forward to use. The product worked great and the beacon I designed appears to work perfectly" -Freddie Peyerl, Beth Israel Deaconess Medical Center, US.
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