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Edits Template sequences to add new
bases or delete unwanted regions.
Exports a publication quality report for
the assays designed for sharing with
colleagues.
Includes a built-in calculator for
computing the GC%, the base count
and to obtain the complement and the
reverse complement.
Automatic Homology & Template Structure Avoidance
Primer Premier automatically interprets the BLAST search results and utilizes a proprietary
algorithm to check for possible secondary structures. Homologies and structures are
avoided for designing highly specific and efficient primers.
Primer Premier PCR引物设计软件
SNP基因型分析的引物设计
使用Primer Premier,您可以从dbSNP加载序列,并将所设计的引物并置在SNP选定的两侧。数百个未发表的SNPs也可以通过在标准GenBank/ dbSNP文件中它们作为变体特性来加载。在SNPs之后,引物设计可以增强他们使用probe-based化学检测。
多重检测
对于多重实验,Primer Premier可以让您在批处理模式下启动引物搜索,然后检查设计的引物的交叉反应性,从而减少错误启动。
Primer Premier's search algorithm finds optimal PCR, multiplex and SNP genotyping primers with the most accurate melting temperature using the nearest neighbor thermodynamic algorithm. Primers are screened for secondary structures, dimers, hairpins, homologies and physical properties before reporting the best ones for your sequence, in ranked order. Equipped with a handy calculator, you can easily manipulate sequences and analyze the results of your primer design.
Primer Premier PCR引物设计软件
自动同源性和避免模板结构
Primer Premier自动解释BLAST搜索结果,并避免那些区域设计与数据库具有显著交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示,并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构,可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠,在您的折叠温度下,程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中,二级结构形成的区域下面用横线强调,并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特,避免模板结构提高设计引物的效率。
手动引物搜索
Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户终选择的引物。
A Comprehensive PCR Primer Design Software
Primer Premier's search algorithm finds optimal PCR, multiplex and SNP genotyping primers with the most accurate melting temperature using the nearest neighbor algorithm. Primers are screened for secondary structures, dimers, hairpins, homologies and physical properties before reporting the best ones for your sequence, in a ranked order. Load the gene of interest from NCBI, select a search range, sit back and let Primer Premier pick the best possible primers for you.
2020年,北京天演融智软件有限公司申请高等教育司产学合作协同育人项目,“大数据”和“机器学习”师资培训项目,以及基于OBE的教考分离改革与教学评测项目已获得批准。我们将会跟更多的高校合作,产学融合协同育人。
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