• 正规代理 购买GPMAW软件以及价格

    正规代理 购买GPMAW软件以及价格

  • 2021-04-30 11:07 45
  • 产品价格:面议
  • 发货地址:北京市海淀区包装说明:不限
  • 产品数量:不限产品规格:不限
  • 信息编号:62991023公司编号:4244767
  • 王经理 经理
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    产品描述
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    Point your browser to the location above (double click on the link) and a list of files on the FTP server is displayed. Right-click on the file named clustalw1.83.DOS.zip and select ‘Copy to folder...’ from the menu. Select an appropriate directory, copy and decompress the file.

    肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
    充电-单次/多次/负/正
    肽数
    位置
    液相色谱指数
    理论PI
    布尔和布雷斯指数
    序列-1/3字母等

    肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
    自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
    GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:


    f part of the sequence is highlighted, the left panel shows the mass of the selected peptide and the right panel shows the first and last residues of the selection (see next section).
    Note that the mass value displayed is M, not M+H.

    GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
    该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
    除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
    程序内容
    GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
    序列处理:通过在Entrez和本地数据库(FastA格式和Swiss-Prot)中直接搜索数据库,从许多不同格式的序列中导入序列。序列可以保存在本地(数据库)中,以备将来参考。从序列窗口可以执行大量操作。序列可以以FastA格式导出(单个序列或同时导出所有序列),以便于传输到其他程序。
    质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave,电荷- Bull&Breese指数,HPLC指数,pI,电荷),并可以进一步工作(如交联,新的分裂)。
    生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分,但是在以前的版本中,您必须自己安装。
    序列窗口
    序列窗口是GPMAW的**窗口并默认显示一个序列。从这里,您可以调用大多数与序列相关的函数(通过菜单、工具栏或弹出菜单)。
    显示1个或3个字母
    平均质量/单同位素质量
    固定残留物宽度
    带有序列信息的提要栏
    显示二硫化物桥、改性残留物等
    通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很容易地在系统设置框中预先设置。
    序列窗口形成父窗口,从中可以创建大量派生子窗口:
    肽窗口
    MS/MS窗口
    批量搜索、合成搜索
    图表:疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮
    肽窗口
    肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是,也有其他方法,如手动或半自动分裂。
    肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
    充电-单次/多次/负/正
    肽数
    位置
    液相色谱指数
    理论PI
    布尔和布雷斯指数
    序列-1/3字母等
    肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
    自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
    GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:
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