ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并**模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
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反向互补序列和色谱图。
通过匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro DNA序列分析软件
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并**模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
Open sequences in Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF and plain text formats.
Save sequences in .ab1, .scf, .fasta and .fastq formats.
Assemble overlapping sequences using a graphical interface, generate a consensus and highlight ambiguities for editing.
Use quality data to automatically remove low quality sequence for improved sequence assembly.
Use a reference sequence as a scaffold for assembly.
Generate restriction site and fragment maps, and list cutters, non-cutters and fragments.
Map open reading frames, aided by a G+C frame plot, and translate ORFs with one click.
Print chromatograms, restriction site and fragment maps, and open reading frame maps.
Perform nucleotide and protein BLAST searches through the NCBI web site.
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
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