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A12 The white on blue ‘i’ opens the sequence information window, which gives you file and statistical information, calculated indices (pI, absorption etc.), amino acid composition and multiply charged masses. The drop-down arrow open a menu giving direct access to the various pages in the information window.
质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave,电荷- Bull&Breese指数,HPLC指数,pI,电荷),并可以进一步工作(如交联,新的分裂)。
生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分,但是在以前的版本中,您必须自己安装。
The GPMAW program is primarily intended as a tool for mass spectrometric analysis of proteins and peptides. However, a number of other bioinformatics tools have been included, so the use of the program extends far beyond simple mass analysis.
A9 Line distance. When the button is pressed, the distance between the sequence lines will be increased for easier viewing.
和*三个是从文献中得出的值(参考在线帮助和手册)。*二个选项基于游离残基的值。*四个和后一个选项基于当前选定的mass文件中的定义,必须选中才能使用这些值。
哪里使用这些值呢?
在各自的信息对话框中计算蛋白质和肽的PI值(从蛋白质或肽窗口,选择“蛋白质/肽信息)。如果选择了列选项,则在肽窗口中计算PI值。
模拟的2-D凝胶使用PI计算。
在DigestAlyzer中,可以选择Pi作为一个轴选项。
在肽窗口中报告电荷。
从蛋白质和肽窗口中调用电荷与ph窗口。
科学软件网不定期举办各类公益培训和讲座,让您有更多机会免费学习和熟悉软件。
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