RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA*沉淀)的实验设计需要考虑多个方面,以确保实验的准确性和可重复性。1. 目标蛋白的选择:确定你想要研究的目标RNA结合蛋白(RBP)。2. 阳性和阴性对照:设计实验时,需要包括阳性对照和阴性对照。3. 细胞培养与裂解:选择合适的细胞类型进行培养。4. 抗体孵育:将特异性抗体与细胞裂解液孵育,以形成抗体-蛋白质-RNA复合物。5. *沉淀:使用蛋白A或蛋白G结合的珠子进行*沉淀,捕获抗体-蛋白质-RNA复合物。6. 洗涤和分离:洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。从珠子上分离RNA,可能需要使用低pH缓冲液或蛋白酶K处理。7. RNA分析:使用qPCR、Northern blot或RNA-Seq等方法分析沉淀下来的RNA。8. 数据分析:对实验结果进行定量分析,比较不同样品之间的RNA水平。9. 实验重复:为了确保结果的可靠性,实验应该进行至少三次重复。 *沉淀技术ChIP的优缺点是什么?南京*沉淀实验原理
10. 技术验证:使用其他技术(如RNA-pull down或FISH)验证RIP实验结果。Co-IP(*共沉淀)技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用,其实验设计如下:1. 样品准备:Co-IP实验通常有两种,一种是内源性蛋白相互作用验证,一种是非内源性蛋白相互作用验证。内源性相互作用通过质粒共转染的方式将两种蛋白转染至同一细胞内表达;非内源性相互作用则是将含有靶蛋白的组织进行预处理及细胞裂解获得细胞裂解液。2. 沉淀诱饵蛋白:利用磁珠偶联抗体沉淀诱饵蛋白。在样品中加入磁珠偶联抗体,抗体会与诱饵蛋白结合,利用磁铁将磁珠拉下,同时诱饵蛋白会一起被沉淀出来。3. SDS-PAGE及WB检测:得到沉淀后,需要验证沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE将蛋白复合物分离,随后利用WB检测是否存在靶蛋白。4. 实验对照设置:为了避免“假阳性”,需要设置正确的对照,包括阴性对照和阳性对照(Input组)。Input组为直接利用抗体对细胞裂解液进行WB检测,验证细胞裂解液中存在蛋白。5. 结果真实性:确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白。使用单克隆抗体有助于避免污染的发生。南京*沉淀实验原理*沉淀IP技术选琼脂糖珠还是磁珠?*沉淀ChIP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有较大的表面积可与蛋白质相互接触,具有较高的结合载量。与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。*沉淀是利用抗体特异性反应纯化富集目的蛋白的一种方法。抗体与细胞裂解液或表达上清中相应的蛋白结合后,再与蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶联的珠子(agarose或Sepharose)孵育,通过离心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗体-目的蛋白复合物,沉淀经过洗涤后,重悬于电泳上样缓冲液,煮沸5-10min,在高温及还原剂的作用下,抗原与抗体解离,离心收集上清,上清中包括抗体、目的蛋白和少量的杂蛋白。*沉淀是一种生物学技术,它利用抗体的特异性结合特性来富集和分离混合物中的特定蛋白质。这种技术是研究蛋白质表达、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质修饰和蛋白质功能的强大工具。*沉淀技术IP的应用有哪些?
*沉淀(immunoprecipitation)是指利用抗体可与抗原特异性结合的特性,将抗原(常为靶蛋白)从混合体系沉淀下来,初步分离靶蛋白的一种方法。*共沉淀(coimmunoprecipitation)是一种在体外探测两个蛋白分子间是否存在特异性相互作用的一种方法。其原理非常简单,如果两个蛋白在体外体系能够发生特异性相互作用的话,那么当用一种蛋白的抗体进行*沉淀时,另一个蛋白也会被同时沉淀下来。与酵母双杂交技术不同,*共沉淀技术所利用的是抗原和抗体间的*反应,是一种基于体外非细胞的环境中研究蛋白质与蛋白质的相互作用的方法。 *沉淀技术ChIP的实验方法。苏州anti Flag*沉淀实验视频
*沉淀抗体的选择?南京*沉淀实验原理
*沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)的实验方法通常包括以下步骤:1. 样本准备2. 蛋白质浓度测定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。3. 抗体预处理:如果使用预固定的抗体,需先将抗体固定在固相支持物上,如琼脂糖珠或磁性微珠。4. *沉淀反应:将裂解液与特异性抗体(固定或未固定)混合,并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜,以允许抗体与目标蛋白质充分结合。5. 固相支持物的回收:对于未固定的抗体,加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。6. 洗涤:去除未结合的蛋白质和杂质,通常需要多次洗涤固相支持物。7. 洗脱:使用适当的洗脱缓冲液(如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液)从固相支持物上洗脱*复合物。8. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等,以进一步分析目标蛋白质。南京*沉淀实验原理
上海世途科生物(CYTOCH)是一家生命科学上游工具类企业,聚焦于细胞生物学相关的化学技术及相关产品的开发与生产,产品覆盖细胞培养,细胞转染及细胞检测等多个科研场景。 世途科生物致力于将自己打造成为**客户信赖的中国生命科学工具品牌,助力**科研工作者在生命科学的探索之旅中不断**突破。










