PC-ORD培训班 正规代理

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Non-metric Multidimensional Scaling (NMS)
Non-metric Multidimensional Scaling (NMS, MDS, NMDS, or NMMDS) is an ordination method that is well suited to data that are nonnormal or are on arbitrary, discontinuous, or otherwise questionable scales.  NMS is generally the best ordination method for community data.  Our auto-pilot feature makes it easy to use.  A Monte Carlo test of significance is included.
NMS Scree Plot graph example

Compare Scores (Compare Ordinations)
Evaluate the similarity of two ordinations, independent of any rotation, reflection, units for axis, and number of dimensions.  This is accomplished by evaluating the correlation between the interpoint distances of two ordinations. Squaring this correlation expresses the redundancy between two ordinations.  A formal test of the hypothesis of no relationship between the two ordinations is provided by a Mantel test.

特征空间中的物种距离
物种可以通过计算物种间的距离矩阵来比较它们的性状，从物种x性状矩阵开始。在数学方面，这与计算物种空间中的样本单元之间的距离矩阵相同，除了在这种情况下，对象是物种，它们的属性是性状，而不是作为样本单元和属性物种的对象。从特征菜单提供相同的距离度量，如物种空间中的样本单元之间的距离。


注意：您仍然可以导入Excel旧版的.wk1文件以及xls和.xlsx文件。

PC-ORD对电子表格中的生态数据进行多变量分析。PC-ORD的重点是非参数工具、图形表示、随机化测试和自举置信区间的社区数据分析。除了用于转换数据和管理文件的实用程序之外，PC-ORD还提供了许多统计数据包中不可用的排序和分类技术：CCA、DCA、指示物种分析、Mantel试验、部分Mantel试验、MRPP、PCoA、perMANOVA、RDA、双向聚类、TWINSPAN、Beals平滑、多样性指数、物种列表、许多排序叠加方法（定量、符号编码、颜色编码、网格、联合图、双情节、连续向量）、各种旋转方法、3D排序、Bray-Curtis排序、城市街区距离测量、物种面积曲线、树数据摘要、发布质量树图、自动驾驶模式的非度量多维范围（NMS或NMDS）。可以分析大型数据集。只要您计算机的内存够，大多数操作接受多32,000行或32,000列和多536,848,900个矩阵元素的矩阵。完整的手册包括上下文敏感的帮助系统。
Ÿ Gower Distance,忽略0,0
Gower(1971)和Legendre以及Lengendre（1998）提出了一个有趣的但未经测试的Gower相似系数的变体，忽略了0,0数据对。如果这些双零点被认为是不明确的信息，那么可以从系数的计算中排除它们。双零点的敏感性在社区生态学的分析中产生了不必要的影响
(Legendre & Legendre 1989, p. 253; McCune & Grace 2002, p. 38, 51)。

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